Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRDM2Q13029 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDM2Q13029 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
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