Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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