Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXF1Q12946 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXF1Q12946 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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FOXF1Q12946 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXF1Q12946 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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FOXF1Q12946 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXF1Q12946 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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