Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPTFQ12830 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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