Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNA1Q09470 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms