Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYP4F3Q08477 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms