Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DDR1Q08345 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms