Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNB2Q08289 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms