Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CXCL9Q07325 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CXCL9Q07325 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms