Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FMODQ06828 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FMODQ06828 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms