Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LTBQ06643 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms