Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms