Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms