Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUCB1Q02818 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms