Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CACNB1Q02641 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 COX16-201ENST00000389912 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 DSTNP1-201ENST00000419906 465 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC00443-201ENST00000421601 1170 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC01096-201ENST00000501050 1263 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms