Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CENPEQ02224 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms