Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms