Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MDM2Q00987 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms