Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms