Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK5Q00535 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK5Q00535 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms