Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms