Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPD2P62316 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms