Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME5P56597 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NME5P56597 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NME5P56597 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME5P56597 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms