Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SMARCA2P51531 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms