Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GSK3BP49841 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms