Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FNTAP49354 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FNTAP49354 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FNTAP49354 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTAP49354 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms