Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5OP48047 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms