Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GDF5P43026 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GDF5P43026 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms