Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms