Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFNP31947 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFNP31947 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFNP31947 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFNP31947 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFNP31947 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFNP31947 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFNP31947 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFNP31947 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms