Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms