Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TM4SF1P30408 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM4SF1P30408 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms