Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2E1P29083 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms