Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms