Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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APCP25054 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APCP25054 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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APCP25054 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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APCP25054 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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APCP25054 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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APCP25054 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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APCP25054 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APCP25054 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APCP25054 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APCP25054 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APCP25054 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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