Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA1P23193 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms