Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCNA2P20248 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms