Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DESP17661 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DESP17661 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DESP17661 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms