Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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