Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EPCAMP16422 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms