Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DSPP15924 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DSPP15924 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms