Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms