Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms