Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBL4AP11441 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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