Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIGD3P0DMS9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms