Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF853P0CG23 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms