Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEFLP07196 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEFLP07196 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFLP07196 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFLP07196 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFLP07196 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFLP07196 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFLP07196 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFLP07196 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEFLP07196 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms