Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms