Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCO2O43819 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCO2O43819 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCO2O43819 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCO2O43819 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCO2O43819 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCO2O43819 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCO2O43819 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCO2O43819 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms