Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYNGR2O43760 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms